Artesis Plantijn Hogeschool Antwerpen
Wetenschap en Techniek
campus Kronenburg
Kronenburgstraat 47 - 2000 Antwerpen
T +32 3 220 55 80 - F +32 3 220 55 99
wt@ap.be
Biochemie II 2FBT9584/1399/1617/1/09
Studiegids

Biochemie II 2FBT

9584/1399/1617/1/09
Academiejaar 2016-17
Komt voor in:
  • Bachelor in de biomedische laboratoriumtechnologie, trajectschijf 2
Dit is een enkelvoudig opleidingsonderdeel.
Studieomvang: 4 studiepunten
Co-titularis(sen): Pittois Karen
Onderwijstalen: Nederlands
Kalender: Module 1 + Module 2
Dit opleidingsonderdeel wordt gequoteerd op 20 (tot op een geheel getal).
Mogelijke grensdata voor leerkrediet: 10.10.2016 (1ste module)
Tweede examenkans: wel mogelijk.
Tolereerbaarheid: Voor dit opleidingsonderdeel is een resultaat van minder dan 10/20 niet tolereerbaar.
Totale studietijd: 104,00 uren

Korte omschrijving

Biochemie is de wetenschappelijke discipline die probeert het fenomeen ‘leven’ te verklaren op moleculair vlak. Men maakt er gebruik van de methodieken en de terminologie van de scheikunde om verschillende aspecten van cellen en levende organismen te beschrijven en te begrijpen.
Deze cursus is het vervolg op de cursus Biochemie 1.

Volgtijdelijkheid

binnen het opleidingsprogramma al minstens 30 studiepunten afgewerkt hebben EN geslaagd of getolereerd voor Biochemie 1 EN geslaagd of getolereerd voor Bio-organische chemie.

Eindcompetenties (lijst)

Interpersoonlijk - Communicatie
consolideert de enzymkinetische experimenten tot 1 geheel
interpreteert de verwerkte data in ruimere context
Intrapersoonlijk - (zelf-)Reflectie
vervolledigt de experimentele opzet met parate en/of opgezochte bronnen
Intrapersoonlijk - Methodologie
formuleert het doel van een enzymkinetisch experiment
Intrapersoonlijk - Probleemanalyse
benoemt de functies van de besproken metabole pathways mbv hun totaalreactie
benoemt suikers, vetzuren, nucleotiden en vitaminen adhv een gegeven structuur en omgekeerd
beoordeelt analyseresultaten van enzymmetingen
berekent het rendement in ATP van een gegeven macromolecule in het algemene anabolisme
beschrijft de belangrijkste chemische eigenschappen van suikers, lipiden en nucleïnezuren
beschrijft de rol van cofactoren zoals, acetyl-CoA-SH, NAD+, NADP+, FAD, binnen één pathway, alsook tussen verschillende pathways
classificeert enzymen volgens reactietype
deelt onbekende structuren in bij groep en subgroep van de verschillende biomoleculen (suikers, lipiden, nucleïnezuren en vitaminen)
leidt de kinetiek van enzymen af
verduidelijkt bijsluiters van enzymbepalingen
vergelijkt enzymkinetische analysemethodes
verklaart het belang van celcompartimentalisatie in de organisatie en regulatie van de geziene pathways
verwerkt data van enzymkinetische experimenten
voorspelt enzymkinetiek obv bijhorende parameters
voorspelt verwerking van enzymkinetische resultaten
Labtechnicus BL - Rapporteren
consolideert de enzymkinetische experimenten tot 1 geheel
Labtechnicus BL - Taakanalyse en Planning laboratoriumwerkzaamheden
benoemt de functies van de besproken metabole pathways mbv hun totaalreactie
benoemt suikers, vetzuren, nucleotiden en vitaminen adhv een gegeven structuur en omgekeerd
berekent het rendement in ATP van een gegeven macromolecule in het algemene anabolisme
beschrijft de belangrijkste chemische eigenschappen van suikers, lipiden en nucleïnezuren
beschrijft de rol van cofactoren zoals, acetyl-CoA-SH, NAD+, NADP+, FAD, binnen één pathway, alsook tussen verschillende pathways
classificeert enzymen volgens reactietype
deelt onbekende structuren in bij groep en subgroep van de verschillende biomoleculen (suikers, lipiden, nucleïnezuren en vitaminen)
formuleert het doel van een enzymkinetisch experiment
leidt de kinetiek van enzymen af
verduidelijkt bijsluiters van enzymbepalingen
vergelijkt enzymkinetische analysemethodes
verklaart het belang van celcompartimentalisatie in de organisatie en regulatie van de geziene pathways
vervolledigt de experimentele opzet met parate en/of opgezochte bronnen
Labtechnicus BL - Verwerken en interpreteren
beoordeelt analyseresultaten van enzymmetingen
interpreteert de verwerkte data in ruimere context
verwerkt data van enzymkinetische experimenten
voorspelt enzymkinetiek obv bijhorende parameters
voorspelt verwerking van enzymkinetische resultaten

Leerinhoud

Biomoleculen
De belangrijke soorten biomoleculen worden besproken. Vele van deze biomoleculen zijn betrokken bij het metabolisme, zowel in het uitvoeren als het regelen van dit proces. De eerste groep zijn de suikers, die niet alleen een sleutelrol spelen in het energiemetabolisme, maar ook uitblinken in de natuur als structuurgevende moleculen.
Ten tweede worden de vetten bekeken. Omdat het leven ontstaan is in een ‘waterwereld’ is het verschil tussen polair en apolair hier zeer belangrijk. Biologische membranen, die het leven afbakenen in microscopisch kleine compartimenten worden zo beter begrepen.
Hierna zullen we de nucleïnezuren en nucleotiden, belangrijke spelers als informatiedragende en energierijke moleculen, kort bekijken. 
Dankzij de studie van de biomoleculen kunnen we het metabolisme, of de opbouw en de afbraak ervan bestuderen. De vitaminen worden bestudeerd als voorbereiding op het deel metabolisme. Het is onmogelijk om alle metabole wegen te beschrijven in de cursus, daarom wordt gekozen om de belangrijkste centrale metabole routes te omschrijven. Van elke route wordt de reeks enzymatische stappen die nodig zijn om een stof op te bouwen of af te breken bekeken. Hierbij wordt de nadruk gelegd op het herkennen van welbepaalde ‘spelers’ en gelijkenissen tussen routes. Hoe worden de biomoleculen omgezet in andere moleculen en wat kost dit aan energie of hoeveel energie komt hierbij vrij? Ook wordt ingegaan op de controle van de metabole flux tijdens deze routes. Want het wonderlijke is dat in een levende cel alle reacties op een geordende manier plaatsvinden en dat er geen nutteloze energie verspild wordt. Door de bespreking van deze routes wordt duidelijk dat de kennis van het metabolisme in de cel kan gebruikt worden voor de productie van geneesmiddelen in de farmaceutische industrie en bij het aanwenden van enzymen in analytische bepalingsmethoden.

Enzymologie
In een eerste deel worden de factoren die de enzymactiviteit bepalen (temperatuur, substraat, activatoren en inhibitoren) afzonderlijk en in hun onderlinge samenhang behandeld. De werkingsvoorwaarden voor substraat- en enzymbepalingen in serum of plasma worden uitgebreid besproken.

In een tweede deel worden de klinisch relevante enzymen besproken evenals de verschillende bepalingsmethoden. Ruime aandacht wordt besteed aan de interpretatie van de resultaten en de analyse van enzympatronen


Studiematerialen (tekst): Verplicht

Verplicht studiemateriaal
  • Cursus Biomoleculen: ppt slides met notities
  • Cursussen Metabolisme: geschreven cursus + ppt slides met notities
  • Oefeningenschrift deel I: Biomoleculen, deel II: Metabolisme
  • Cursustekst Enzymologie  (2 delen)
  • Praktijkcursus Enzymologie
  • Bijsluiters van verschillende firma's
  • E-campus voor presentaties, extra oefeningen, externe links
  • Molecuulmodellen
Aanbevolen studiemateriaal
  • ‘Inleiding in de bio-organische chemie’, Engbersen, J.F.J, De Groot, AE., Wageningen pers, 1995, ISBN-10 90-74134-21-1
  • 'Organic Chemistry', Mc Murry, J., Brooks/Cole-Thomson Learning, 2004, ISBN 0-534-42005-2
  • ‘Sesam Atlas van de biochemie’, Koolman, J., Röhm, K.-H., SESAM, 2004, ISBN 90-5574-443-3
  • ‘Biochemistry’, Garrett, R.,H., Grisham, C. M., Brooks/Cole-Thomson Learning, 2005, ISBN 0-534-41020-0
  • 'Lippincott's illustrated reviews: Biochemistry', Denise R. Ferrier, Wolters Kluwer, 2014, ISBN, 978-1-4511-7562-2
  • Appling, D.R., Anthony-Cahill, S.J. & Mathews, C.K. (2016). Biochemistry, concepts and connections',  Pearson. ISBN 978-1-292-11200-8

Onderwijsorganisatie

Examentijd
Voorziene tijd voor toetsing4,00 uren
Werkvormen
Hoor- en/of werkcolleges35,50 uren
Practicum en/of oefeningen
Vormen van groepsleren
Werkplekleren en/of stage
Werktijd buiten de contacturen64,50 uren

Toetsing (lijst)

Evaluatie(s) voor de eerste examenkans
MomentVorm%Opmerking
AcademiejaarKennistoets50,00Facet Werken met enzymen
Schriftelijk examen. Gesloten boek. Open en gesloten vragen. De vragen peilen naar kennis en toepassen van kennis en inzicht. Toegestane hulpmiddelen: molecuulmodellen. Definitieve toets in de tussentijdse toetsweek.
AcademiejaarKennistoets50,00Facet BiomoleculenSchriftelijk examen. Gesloten boek. Open en gesloten vragen. De vragen peilen naar kennis en toepassen van kennis en inzicht. Toegestane hulpmiddelen: molecuulmodellen.
Evaluatie(s) voor de tweede examenkans
MomentVorm%Opmerking
Tweede examenperiodeKennistoets50,00Facet BiomoleculenSchriftelijk examen. Gesloten boek. Open en gesloten vragen. De vragen peilen naar kennis en toepassen van kennis en inzicht. Toegestane hulpmiddelen: molecuulmodellen.
Tweede examenperiodeKennistoets50,00Facet Werken met enzymenSchriftelijk examen. Gesloten boek. Open en gesloten vragen. De vragen peilen naar kennis en toepassen van kennis en inzicht. Toegestane hulpmiddelen: molecuulmodellen.

Toetsing (tekst)