geslaagd of getolereerd voor Biochemie 1 EN geslaagd of getolereerd voor Bio-organische chemie.

Biochemie is de wetenschappelijke discipline die probeert het fenomeen ‘leven’ te verklaren op moleculair vlak. Men maakt er gebruik van de methodieken en de terminologie van de scheikunde om verschillende aspecten van cellen en levende organismen te beschrijven en te begrijpen.

Enzymkinetiek is de studie van de kinetiek van chemische reacties die gekatalyseerd worden door enzymen. Deze reacties zijn belangrijk om metabole processen te begrijpen en kennen vele toepassingen in laboratoria.

Deze cursus is het vervolg op de cursus Biochemie 1.

Biomoleculen
De belangrijke soorten biomoleculen worden besproken. Vele van deze biomoleculen zijn betrokken bij het metabolisme, zowel in het uitvoeren als het regelen van dit proces. De eerste groep zijn de suikers, die niet alleen een sleutelrol spelen in het energiemetabolisme, maar ook uitblinken in de natuur als structuurgevende moleculen.
Ten tweede worden de vetten bekeken. Omdat het leven ontstaan is in een ‘waterwereld’ is het verschil tussen polair en apolair hier zeer belangrijk. Biologische membranen, die het leven afbakenen in microscopisch kleine compartimenten worden zo beter begrepen.
Hierna zullen we de nucleïnezuren en nucleotiden, belangrijke spelers als informatiedragende en energierijke moleculen, kort bekijken. 
Dankzij de studie van de biomoleculen kunnen we het metabolisme, of de opbouw en de afbraak ervan bestuderen. De vitaminen worden bestudeerd als voorbereiding op het deel metabolisme. Het is onmogelijk om alle metabole wegen te beschrijven in de cursus, daarom wordt gekozen om de belangrijkste centrale metabole routes te omschrijven. Van elke route wordt de reeks enzymatische stappen die nodig zijn om een stof op te bouwen of af te breken bekeken. Hierbij wordt de nadruk gelegd op het herkennen van welbepaalde ‘spelers’ en gelijkenissen tussen routes. Hoe worden de biomoleculen omgezet in andere moleculen en wat kost dit aan energie of hoeveel energie komt hierbij vrij? Ook wordt ingegaan op de controle van de metabole flux tijdens deze routes. Want het wonderlijke is dat in een levende cel alle reacties op een geordende manier plaatsvinden en dat er geen nutteloze energie verspild wordt. Door de bespreking van deze routes wordt duidelijk dat de kennis van het metabolisme in de cel kan gebruikt worden voor de productie van geneesmiddelen in de farmaceutische industrie en bij het aanwenden van enzymen in analytische bepalingsmethoden.

Enzymologie
In een eerste deel worden de factoren die de enzymactiviteit bepalen (temperatuur, substraat, activatoren en inhibitoren) afzonderlijk en in hun onderlinge samenhang behandeld. De werkingsvoorwaarden voor substraat- en enzymbepalingen in serum of plasma worden uitgebreid besproken.

In een tweede deel worden de klinisch relevante enzymen besproken evenals de verschillende bepalingsmethoden. Ruime aandacht wordt besteed aan de interpretatie van de resultaten en de analyse van enzympatronen

Verplicht studiemateriaal

• Cursus Biomoleculen: ppt slides met notities
• Cursussen Metabolisme: geschreven cursus + ppt slides met notities
• Oefeningenschrift deel I: Biomoleculen, deel II: Metabolisme
• Cursustekst Enzymologie  (2 delen)
• Bijsluiters van verschillende firma's
• Digitap voor presentaties, extra oefeningen, externe links
• Molecuulmodellen

Aanbevolen studiemateriaal

• ‘Inleiding in de bio-organische chemie’, Engbersen, J.F.J, De Groot, AE., Wageningen pers, 1995, ISBN-10 90-74134-21-1
• 'Organic Chemistry', Mc Murry, J., Brooks/Cole-Thomson Learning, 2004, ISBN 0-534-42005-2
• ‘Sesam Atlas van de biochemie’, Koolman, J., Röhm, K.-H., SESAM, 2004, ISBN 90-5574-443-3
• ‘Biochemistry’, Garrett, R.,H., Grisham, C. M., Brooks/Cole-Thomson Learning, 2005, ISBN 0-534-41020-0
• 'Lippincott's illustrated reviews: Biochemistry', Denise R. Ferrier, Wolters Kluwer, 2014, ISBN, 978-1-4511-7562-2
• Appling, D.R., Anthony-Cahill, S.J. & Mathews, C.K. (2016). Biochemistry, concepts and connections',  Pearson. ISBN 978-1-292-11200-8

Gewicht van de verschillende facetten

Biomoleculen 50%

Werken met enzymen 50%

De facetten worden op 2 verschillende dagen (apart) geëxamineerd.

De effectieve examenvorm en examentijd worden gecommuniceerd via digitap. De examentijd bevat een zelfde tijdsverlenging voor alle studenten. Voor digitale examens: Het niet opstarten of afsluiten van de monitoringsoftware wordt aanzien als fraude.